在日本，食品类商品的包装是禁止标明“药效”的。然而随着容易使消费者产生药效期待的“健康食品”在市场中泛滥，日本厚生劳动省制定了新的保健功能标示和规格标准，称为保健功能食品制度。
保健功能食品制度把符合国家基准和规定的健康食品分为了“特定保健用食品”“营养功能食品”和“功能性标示食品”。其中：特定保健食品是指包装上明确标明食品具有特定保健用途的食品，此类食品必须经过国家的有效性和安全性审查；营养功能食品则是一类以补充特定营养成分为目的食品；而第三类功能性标示食品则是一直需要企业提供食品功能性的科学根据，此类产品售卖前，其安全性及功能性的依据等材料必须向消费者厅长官提出，申请许可受理。
与其他国家相比，在日本，功能食品产业更加发达，其中很多产品受到欢迎。
难消化性糊精
在日本，食用变性淀粉的市场占有率达80%。另外，水溶性膳食纤的四大生理功效，即调理肠道、抑制血糖值上升、减肥、降低胆固醇的功能已获得日本劳动厚生省的认定。如日本松谷化学工业株式会社在1988年就推出了一种以玉米淀粉为来源的水溶性膳食纤维。此纤维有50%不会被人体消化吸收，被称为“难消化性糊精”，也有人称为“抗性糊精”。
GABA
γ-氨基丁酸（简称GABA）是一种天然存在的非蛋白质氨基酸，广泛分布和存在于动植物体内，也是哺乳动物中枢神经系统中重要的抑制性神经传达物质，约30%的中枢神经突触部位以GABA为递质，促进脑部血液循环和氧的供给量。GABA在人体大脑皮质、海马、丘脑、基底神经节和小脑中起重要作用，并对机体的多种功能具有调节作用，如舒缓脑部紧张状态，促进良好的睡眠和生长激素的合成。因此当人体内GABA缺乏时，会产生焦虑、不安、忧虑、精神萎靡等情绪。
EPA/DHA
EPA是Eicosapentaenoic Acid 即二十碳五烯酸的英文缩写，是鱼油的主要成分。EPA属于ω-3系列多不饱和脂肪酸，是人体不可缺少的重要营养素。虽然亚麻酸在人体内可以转化为EPA，但此反应在人体中的速度很慢且转化量很少，远远不能满足人体对EPA的需要，因此必须从食物中直接补充。而DHA的功能作用更是早被日本人熟知。
银杏叶
研究表明，银杏叶含有很多黄酮，可以有效防止血管老化，提高血管的弹性和韧性，从而降低血压。银杏叶可以有效清除血管上的沉淀物质，如果这些物质堵塞血管，容易形成血栓。而银杏叶可以疏通血管，让血液变得流畅。
透明质酸钠
人在胚胎时期体内透明质酸钠含量最高，出生后逐渐减少，相同年龄段的人群所含透明质酸钠的量也不同。体内透明质酸钠含量减少将直接导致皮肤的衰老和身体机能的衰退，早老症患者的透明质酸钠含量就明显减少。
外用透明质酸钠仅作用于涂抹部位的皮肤表层，起到润滑、保水作用，有很大的局限性。而口服透明质酸钠通过消化吸收，增加了内源性透明质酸钠的含量，使皮肤滋润亮泽，富有弹性。
双歧杆菌
双歧杆菌是人体肠道中重要的有益细菌群，与人相伴一生。据医学观察，健康人群体内双歧杆菌数量特别丰富。世界上不少长寿地区的长寿老人，其肠道双歧杆菌仍然保持着青壮年人的水平。
双歧杆菌在肠道黏膜上生长，形成了一道菌膜屏障，犹如在人体肠道表面构筑起一座长城，从而使入侵的致病菌在肠道内失去生长繁殖的落足点。不仅如此，这些有益菌还能刺激肠道的免疫系统、淋巴组织，产生分泌性抗体免疫球蛋白A，激活淋巴细胞的非特异性免疫功能，使中性粒细胞、巨噬细胞增殖。
茶氨酸
茶氨酸（L-Theanine）是茶叶中特有的游离氨基酸，有甜味，其含量因茶的品种、部位而不同。茶氨酸在干茶中占重量的1%-2%。
叶黄素
玉米黄素和叶黄素存在于机体各组织中，其中以眼部组织最为突出。玉米黄素主要存在于视网膜中心凹区域，而叶黄素则主要存在于视网膜周围区域。叶黄素是人体无法制造的，必须靠摄入补充，如果缺乏这种元素，视力会受到影响。叶黄素和玉米黄质可以预防老年黄斑变性、视网膜色素变性等病变的发生。此外，叶黄素还可保护视力、延缓近视的加深、缓解视疲劳。
多年来，叶黄素在科研界持续火热的原因之一，就是其健康效果不断被临床研究所证实，脑部健康就是其中一个。最近几年，关于叶黄素在脑部方面的研究一直都很热。视网膜组织、视神经和脑部组织相临近的位置，在部分程度上决定了叶黄素具有保护眼睛的同时，也可改善脑部健康。
大豆异黄酮
大豆异黄酮是大豆生长中形成的一类次级代谢产物，属于植物营养素的一种。大豆及豆制品是大豆异黄酮的主要食物来源。除此之外，小麦、黑米、扁豆、洋葱、苹果、石榴、银杏、葵花子和橙汁等食物中含量相对较多。
大豆异黄酮可以与雌激素受体结合，发挥类似雌激素样的作用，但是效果比雌激素弱得多，故被称为植物雌激素。
